怪杰少女侦探团极上生徒会不可思议的谜团之一就是小美女管理员。本来应该是小学生的管理员，平时到底过着怎样的生活呢。由梨乃带领，集结生徒会而成的侦探团将解开谜题。就在此时，众人在管理员的房间里发现了一支魔杖。